Я просто не совсем понимаю почему на hls проблемы с несколькими аудио дорожками?
Так это от прокси не зависит абсолютно.... Это AceStream, если у него в настройках установлен hls отдаёт только одну дорожку... если стоит original или http (что в принципе одно и то же) то отдаёт так как есть в источнике, тоесть с всеми дорожками... Как я понимаю здесь особенности работы движка AceStream.
Так же в движе AceStream есть возможность запрашивать тип потока не через настройки, а через API, что и делает прокся, если у неё поставить в настройках hls...
Тоесть, в настройках движка стоит http, а прокся просит у него hls, движек будет отдавать в hls.
Попробуйте у себя в настройках AceStream поставить HLS и увидите, что на тех каналах где было несколько дорожек, осталась одна, и это не зависит от прокси.